Suomen Syöpäinstituutin säätiön tarkoituksena on tehostaa ja edistää Suomessa harjoitettavaa korkeatasoista syöpätutkimusta ja näin edesauttaa syöpien ehkäisyä ja hoitoa. Toteutamme tarkoitustamme määräaikaisten eri uravaiheisiin kohdennettujen  tutkijantoimien ylläpitämisellä, järjestämällä kansainvälisiä symposiumeja ja toimimalla asiantuntijaorganisaationa syöpätutkimukseen liittyen. Syöpäinstituutti toimi aloitteentekijänä Kansallisen syöpäkeskuksen FICANin perustamiseksi ja edelleen edistämme yhteiskunnallista keskustelua syövänhoidon kehityksestä ja syöpätutkimuksesta koordinoimassamme Yksilöllisen syövänhoidon mallimaa -hankkeessa. Osallistumme myös aktiivisesti kansallisen syöpästrategian laatimiseen sekä iCANDOC-tohtorikoulutuspilotin toteutukseen.  Syöpäinstituutti on toiminut perustamisestaan lähtien läheisessä yhteistyössä toimintaamme rahoittavan Syöpäsäätiön kanssa. Toinen keskeinen yhteistyökumppanimme on K. Albin Johanssons Stiftelse, joka rahoittaa Syöpäinstituutissa toimivia nimikkotutkijoitaan.