Suomen Syöpäinstituutin säätiö sr:n tarkoituksena on tehostaa ja edistää Suomessa harjoitettavaa korkeatasoista syöpätutkimusta ja näin edesauttaa syöpien ehkäisyä ja hoitoa. Toteutamme tarkoitustamme määräaikaisten eri uravaiheisiin kohdennettujen  tutkijantoimien ylläpitämisellä, järjestämällä korkeatasoisia kansainvälisiä symposiumeja ja toimimalla asiantuntija-organisaationa syöpätutkimukseen liittyen. Syöpäinstituutti toimi aloitteentekijänä Kansallisen syöpäkeskuksen FICANin perustamiseksi ja edelleen edistämme yhteiskunnallista keskustelua syövänhoidon kehityksestä ja tutkimuksesta Yksilöllisen syövänhoidon mallimaa -hankkeessa. Syöpäinstituutti on toiminut perustamisestaan lähtien läheisessä yhteistyössä  toimintaamme rahoittavan Syöpäsäätiö sr:n kanssa. Nykyisin toinen keskeinen yhteistyökumppanimme on K. Albin Johanssons Stiftelse sr, joka rahoittaa Syöpäinstituutissa toimivia nimikkotutkijoitaan.